Bên cạnh việc nâng cấp các cửa hàng, Bách Hóa Xanh cũng tính chuyện ngừng hoạt động với những cửa hàng không có tiềm năng nâng cấp lên mô hình chuẩn, hoặc không đạt ngưỡng doanh thu tối thiểu để hòa vốn.